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Bioinformatique

  Liste des signets
Canadian bioinformatics workshopsEMBLEMBnet - European molecular biology networkEnzyme database - BRENDAGenopole Toulouse Midi-Pyrénées : accueilInstitut Jacques Monod National center for biotechnology informationReNaBI : Réseau national des plates-formes bioinformatiques

Canadian bioinformatics workshops
Bioinformatics.ca


Pays : Canada Langue(s) : anglais
Auteur(s) : Canadian genetic diseases network = CGDNHerst, Stephen
Ce site canadien, dédié à la présentation de stages spécialisés en bioinformatique, héberge le répertoire Bioinformatics links directory, recensant plusieurs centaines de sites, outils et bases de données.
Tous les sites répertoriés le sont d'après les recommandations d'experts en ce domaine.
http://bioinformatics.ca/
contient en particulier :
  Bioinformatics links directoryRépertoire internet recensant plusieurs centaines de sites dédiés à la bioinformatique.
Date de dernière vérification : 03/02/2012
Département Sciences et techniques
Type : Fournisseurs_d'information : Centres de recherche (instituts, sociétés savantes...)Outils_de_référence : Répertoires Internet
Thème(s) : Sciences et techniquesSciences biologiquesBioinformatique

EMBL
European Molecular Biology Laboratory


Pays : Union européenne Langue(s) : anglais
Auteur(s) : European Molecular Biology Laboratory  = EMBL
Vingt pays, majoritairement européens, animent ce laboratoire collaboratif spécialisé en biologie moléculaire. Ses missions consistent en la recherche, le développement de nouvelles technologies, la fourniture de services destinés à la communauté scientifique, l'organisation de cours et le transfert de technologie en biologie moléculaire. Ce site propose un lien vers chacune des cinq antennes principales du projet (Grenoble, Hambourg, Heidelberg, Ebi Hinxton et Monterotondo) et donne un aperçu des principaux axes de recherche qu'il développe.
Le laboratoire EMBL héberge également un institut spécialisé en bioinformatique, le European bioinformatics institute, présentant de nombreuses bases de données spécialisées.
Lien vers la base de données Ensembl plants, dédiée à la génétique végétale.
http://www.embl.org/
contient en particulier :
  EMBL GrenobleSection française de l'EMBL.
Date de dernière vérification : 03/02/2012
Département Sciences et techniques
Type : Fournisseurs_d'information : Organisations gouvernementalesSources_d'information_primaire : Littérature grise
Thème(s) : Sciences et techniquesSciences biologiquesBiologie moléculaire, génétique
Sciences et techniquesSciences biologiquesBioinformatique
voir aussi European bioinformatics instituteEMBL-EBI est un institut de bioinformatique produisant des bases de données spécialisées en biologie moléculaire.
Ensembl genomes browserLa base de données Ensembl plants, spécialisée en génétique végétale, est une ressource librement accessible en ligne. Elle est développée conjointement par EMBL-EBI et le Cold Spring Harbor laboratory.
Signet(s) : Cold Spring Harbor laboratoryCold Spring Harbor laboratory

EMBnet - European molecular biology network


Pays : Pays-Bas Langue(s) : anglais
Auteur(s) : European molecular biology network
Fondation européenne à but non-lucratif, EMBnet est un réseau collaboratif de centres d'excellence spécialisés en bioinformatique.
Son site donne accès à des informations sur le réseau et sur ses activités (congrès), à des guides concernant des bases de données, ainsi qu'à une liste de sites internet commentés.
http://www.embnet.org/
Date de dernière vérification : 03/02/2012
Département Sciences et techniques
Type : Fournisseurs_d'information : Organisations (associations, fondations)
Thème(s) : Sciences et techniquesSciences biologiquesBioinformatique

Enzyme database - BRENDA
BRENDA : the comprehensive enzyme information system


Pays : Allemagne Langue(s) : anglais
Auteur(s) : Schomburg , Dietmar (1950-....)
BRENDA est une banque de données spécialisée en enzymologie, mise à jour et développée par l'Institut de biochimie et de bioinformatique de la Technical University de Braunschweig (Allemagne).
Une sélection de liens web est disponible sous la rubrique Related links.
http://www.brenda-enzymes.info/
Date de dernière vérification : 03/02/2012
Département Sciences et techniques
Type : Fournisseurs_d'information : Universités et établissements d'enseignementOutils_de_référence : Bases de données
Thème(s) : Sciences et techniquesSciences biologiquesBioinformatique
Sciences et techniquesSciences biologiquesBiologie moléculaire, génétique

Genopole Toulouse Midi-Pyrénées : accueil
Genotoul
Genopole Toulouse Midi-Pyrénées : un réseau de plateformes en sciences du vivant


Pays : France Langue(s) : français
Auteur(s) : Institut national de la recherche agronomique (France) Chevalet, Claude
La Génopole de Toulouse Midi-Pyrénées a pour missions le développement des infrastructures nécessaires à l'étude des génomes et à celle de leur expression, la promotion de grands projets interdisciplinaires de génomique, le développement de la bioinformatique et de l'innovation.
Elle offre aujourd'hui un réseau régional de plateformes de recherche en sciences du vivant, spécialisées - entre autres - en génomique, protéomique, bioinformatique et bioéthique. Un site internet est dédié à chacune de ces plateformes, présentant les actualités de la recherche dans chaque domaine et donnant accès à des outils destinés aux chercheurs.
http://www.genotoul.fr/
contient en particulier :
  Plateforme bioinformatiqueLa plateforme bioinformatique IbiSA de Toulouse met à disposition de la communauté scientifique des ressources informatiques et bioinformatiques en vue de l'exploitation à grande échelle des données produites par les programmes scientifiques dans le domaine de la biologie et de la bioinformatique.
Plateforme génomiqueL'objectif de cette plateforme est de mettre à la disposition des équipes de recherche des robots de pointe et un réseau de compétences dans le domaine de la génomique.
Plateforme génétique et société - SocietalPlateforme constituant un lieu de réflexion et d'information sur les enjeux sociétaux des biotechnologies et sur la bioéthique.
Date de dernière vérification : 03/02/2012
Département Sciences et techniques
Type : Fournisseurs_d'information : Centres de recherche (instituts, sociétés savantes...)
Thème(s) : Sciences et techniquesSciences biologiquesRessources documentairesOrganismes de recherche, institutions
Sciences et techniquesSciences biologiquesBiologie moléculaire, génétique
Sciences et techniquesSciences biologiquesBioinformatique
Sciences et techniquesAgronomieOrganismes de recherche
voir aussi
Signet(s) : ReNaBI : Réseau national des plates-formes bioinformatiquesReNaBI : Réseau national des plates-formes bioinformatiques

Institut Jacques Monod
IJM


Pays : France Langue(s) : français
Auteur(s) : Lepesant, Jean-AntoineInstitut Jacques Monod (Paris)
Fondé en 1966, l'Institut Jacques-Monod (IJM) constitue aujourd'hui l'un des principaux pôles de recherche fondamentale en biologie de la région parisienne. Il comprend 30 équipes de recherche réparties en quatre programmes : "Biologie cellulaire", "Développement et neurobiologie", "Génomes et épigénomes" et "Pathologie moléculaire et cellulaire".
Son site permet d'accéder à une présentation des activités de l'Institut et à l'actualité scientifique, mais également à des rubriques dédiées spécialement à la recherche, à l'enseignement dispensé, ainsi qu'aux plates-formes technologiques développées par l'Institut.
La rubrique "Ressources" donne accès à des outils pour la recherche en bio-informatique.
Des publications en texte intégral sont, par ailleurs, accessibles en ligne (rubrique "La recherche", "Publications").
http://www.ijm.fr/
contient en particulier :
  Publications de l'Institut Jacques MonodAccès aux publications de l'Institut Jacques Monod - majoritairement en texte intégral.
Bio-informatique - IJMOutils bio-informatiques pour la simulation, l'analyse de la structure des génomes, de l'expression des gènes ou des données protéomiques.
Date de dernière vérification : 06/01/2012
Département Sciences et techniques
Type : Fournisseurs_d'information : Centres de recherche (instituts, sociétés savantes...)
Thème(s) : Sciences et techniquesSciences biologiquesRessources documentairesOrganismes de recherche, institutions
Sciences et techniquesSciences biologiquesBioinformatique

National center for biotechnology information
NCBI


Pays : Etats-UnisRoyaume-Uni Langue(s) : anglais
Auteur(s) : National library of medecine (Etats-Unis)National institute of health (Etats-Unis)
La mission du NCBI est de favoriser le développement de technologies informatiques nécessaires au stockage et à l'analyse des données issues des recherches en biologie moléculaire et en génétique. Alimenté par la National library of medicine (NLM) et le National institutes of health (NIH), son site offre de nombreux accès à des bases de données, outils et ressources pédagogiques en ligne.
Accès aux principales bases de données de biologie moléculaire et de génétique. Permet également d'accéder librement - et en texte intégral - à plusieurs milliers d'articles de médecine et de biologie, via les bases PubMed et PubMed Central.
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/
contient en particulier :
  Entrez, the life science search engineMétamoteur de recherche du NCBI qui permet d'effectuer des recherches transversales sur l'ensemble des bases de données et sites internet hébergés sur ce site. Accès à Genome, OMIM, PubMed, PubMed Central, etc.
NCBI Human genome resourcesGuide des ressources en ligne sur le génome humain.
GenBank Banque de gènes en accès libre.
Date de dernière vérification : 03/02/2012
Département Sciences et techniques
Type : Fournisseurs_d'information : Centres de recherche (instituts, sociétés savantes...)Outils_de_référence : Bases de donnéesSources_d'information_primaire : Littérature grise
Thème(s) : Sciences et techniquesSciences biologiquesBiologie moléculaire, génétique
Sciences et techniquesSciences biologiquesBioinformatique
voir aussi
Signet(s) : PubMedPubMed

ReNaBI : Réseau national des plates-formes bioinformatiques
Welcome to ReNaBI : french bioinformatics platforms network


Pays : France Langue(s) : français
Auteur(s) : Consortium national de recherche en génomique
Portail fédérant les plateformes françaises de bioinformatique - 13 au total, dont 8 dépendant du Genopole. Un accès direct à chacune des plateformes est assuré, ainsi qu'un accès thématique à leurs outils, banques de données, tutoriels et autres ressources.
Ce site comporte en outre une rubrique dédiée à l'enseignement, des liens vers d'autres sites de bioinformatique et un onglet portant sur l'actualité dans le domaine de la bioinformatique.
http://www.renabi.fr/
Date de dernière vérification : 03/02/2012
Département Sciences et techniques
Type : Fournisseurs_d'information : Centres de recherche (instituts, sociétés savantes...)Outils_de_référence : Bases de donnéesSources_d'information_primaire : Logiciels et systèmes experts
Thème(s) : Sciences et techniquesSciences biologiquesBioinformatique